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Microorganismes et environnement

Intitulé du Master : Microbiologie appliquée

Semestre : 3

Intitulé de l’UE : Fondamentale

Intitulé de la matière : Microorganismes et environnement

Crédits : 6

Coefficients : 3

Objectif de l’enseignement : 

L’objectif essentiel de ce module est :

1. Identifier les différents types de micro-organismes présents dans l'environnement.
2. Expliquer les rôles des micro-organismes dans les cycles biogéochimiques.
3. Analyser les interactions entre les micro-organismes et leur milieu naturel.
4. Appliquer des méthodes pour isoler et cultiver les micro-organismes environnementaux.
5. Évaluer l'impact des micro-organismes sur la qualité de l'eau, du sol et de l'air.
6. Maîtriser les techniques qui permettent de les utiliser surtout dans la dépollution de  l’environnement. 
7. Concevoir des stratégies utilisant les micro-organismes pour des applications en bioremédiation.

8. Comprendre le rôle des microorganismes dans  l’environnement : dans les écosystèmes aquatiques, terrestres et l’air.

Connaissances préalables recommandées : 

Microbiologie générale, systématique et écologie microbienne.  

Contenu de la matière : 

Cours :

1- Définitions : écologie, éléments biotiques, l’écosystème, l’environnement, l’habitat et le  microbiote.

2- Les microorganismes dans la nature : écosystèmes microbiens, microenvironnements,  activités

3- Nutrition et croissance

4- Interactions microbiennes

5- Méthodes d’étude : mesure de la biodiversité

6- Microbiologie des eaux : eaux marines (microbiologie marine), eau douces,  microbiotes aquatiques

7- Microbiologie des sols : 

 8- Microbiologie du tube digestif : 

9- Écosystème rumen

10- Écosystèmes extrêmes 

11- Cycles biogéochimiques des éléments nutritifs : 

  TP et TD :

1- mise en évidence des microorganismes de l’environnement

2- isolement des microorganismes de sites pollués 

3- application de certaines souches dans le traitement des eaux polluées

4- application de certaines souches bactériennes dans la biodégradation d’un  hydrocarbure

Mode d’évaluation : 

Continu : 40% (TP+ travail personnel)

Examens final : 60% (EMD : 1)

 


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