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Microbiologie de l’environnement 2024.2025

Module: Microbiologie de l'environnement.

Niveau: 3ème année Licence Microbiologie.

Semestre : 6

Unité d’enseignement Fondamentale 1

Crédits : 6,  Coefficient : 4

Objectifs de l’enseignement :  

Cet enseignement permet la connaissance des relations existantes entre le microorganisme et
le milieu constitué par les eaux, les sols ou le tube digestif de l’homme et de l’animal.  
Les principaux groupes de microorganismes (indicateurs ou spécifiques) dans ces différents
écosystèmes et les interactions microbes-(faune, eaux, végétaux, sols) sont particulièrement
étudiés. Le rôle des microorganismes dans les différents cycles de la matière vivante (cycles
biogéochimiques des éléments) est également largement évoqué.

Connaissances préalables recommandées :

Les notions de base de la microbiologie générale

- Les différents types des microorganismes.
- Rôle des microorganismes dans l’environnement.

Contenu de la matière : 

Introduction:

 Notion d’écosystème ; place, diversité et spécificité des microorganismes.

Chapitre I : La microbiologie des eaux

1.Les eaux naturelles
2. Les eaux usées
3. Les eaux brutes et leur potabilité

Chapitre II : La microbiologie du sol

1.Spécificité de l’écosystème tellurique
2. La microflore du sol : principaux groupements microbiens
3. Interactions avec la faune, les eaux et les végétaux
4.  La fixation d’azote : symbiose légumineuses-Rhizobium 

Chapitre III : Éléments de microbiologie du tube digestif

1. La microflore digestive de l’homme
2. La microflore du tube digestif des ruminants

Chapitre IV : Contaminations et hygiène des locaux  

1. Sources de contaminations microbiennes: air, eaux, matières premières, personnel
2.1Principales contaminations: milieux hospitaliers, milieux industriels
3. Règles d'hygiène et normes de sécurité
4.  Désinfection des locaux

Travaux pratiques :  

TP1: 

Isolement et caractérisation des microorganismes à partir des eaux :

Eau usée, eau de robinet, eau de source naturelle (non conditionnée)

TP2 : 

Isolement et caractérisation des microorganismes à partir du sol 

TP3 : 

Isolement et caractérisation des microorganismes à partir de l’air

Mode d’évaluation :  

Contrôle continu (des Quiz sur Moodle)  et Examen semestriel .

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